O clima da Serra de Montejunto é claramente influenciado por três factores, para além da latitude a que se situa a serra: os valores de altitude que apresenta, a proximidade do oceano e a sua orientação relativamente aos ventos mais frequentes.

O Oceano Atlântico, situado 30km a W do alinhamento montanhoso, confere ao clima uma influência marítima. Contudo, essa influência não é idêntica em toda a Serra uma vez que a sua orientação SW-NE é, grosso modo, concordante com o traçado da linha de costa e, sobretudo, funciona como uma barreira à orientação dos ventos marítimos dominantes.

De facto, a disposição SW-NE da Serra de Montejunto, proporciona características climáticas bastante diferenciadas nas duas encostas principais, a exposta a NW (aos fluxos de ar oceânicos) e a exposta a SE (em direcção à Bacia do Tejo).