A diversidade de fragas, grutas e algares na Serra de Montejunto permite a existência, num contexto regional, de uma fauna rupícola característica e diversificada. Das 73 espécies citadas como ocorrendo nesta serra, foi possível registar a observação de 58 espécies, sendo de citar, pela sua importância e estatuto conservacionista, a Águia-perdigueira (Hieraaetus fasciatus), o Bufo-real (Bubo bubo), o Corvo (Corvus corax) e o Melro-Azul (Monticola solitarius).